Niels Sandal

Forskningsprojekt

LORE1 mutantpopulation og analyse af nye symbiotiske mutanter

For at kunne karakterisere funktionen af et specifikt gen, er det vigtigt at have adgang til plantelinier, der bærer mutationer i netop det gen. I CARB grundforskningscentret har vi brugt det mobile element Lotus retrotransposon 1 (LORE1) til at opbygge en stor mutantpopulation, hvor vi ved hjælp af high-throughput Illumina-sekventering har identificeret alle mutationer i hver enkelt plantelinje. Denne store og velkarakteriserede population screener vi nu for symbiotiske fænotyper. Når vi har fundet en interessant mutant, kan vi hurtigt identificere det muterede gen, fordi populationen er sekventeret. Projektet sigter mod identifikation og detaljeret karakterisering af nye symbiotiske mutanter for at forbedre forståelsen af symbiotiske interaktioner.  Til dette formål arbejdes ligeledes med isolation og karakterisering af de gener ved hjælp af kort baseret kloning og genom sekventering.