Vijay Shankar Balakrishnan: Peptid antibiotika – nye våben i krigen mellem mennesker og mikrober?
Ph.d.-forsvar, mandag den 19. november 2012. Cand.scient. Vijay Shankar Balakrishnan.
Evolution finder sted i alle levende organismer. Sygdomsfremkaldende (patogene) mikroorganismer er ingen undtagelse. Nærmest før vi var færdig med at fejre opdagelsen af penicillin og dusinvis af andre antibiotika, begyndte vi at blive klar over, hvordan patogener udvikler antimikrobiel modstandsdygtighed eller resistens. De såkaldte konventionelle antibiotika går målrettet efter de patogene organismers genetiske maskineri, såsom DNA, RNA, ribosomer og de processer, de er involveret i. For få årtier siden begyndte forskerne at blive opmærksomme på små peptider produceret af højere organismer, såkaldte defensiner, som udgør en del af deres iboende immunitet. Disse antimikrobielle peptider (AMP’ere) rammer cellemembranerne, som udgør ”nanogrænsen” for alle celler, i dette tilfælde de bakterielle celler. Membraner er ikke så nøje kontrolleret af cellegenetik og kan derfor ikke så let modificeres ved genetiske mutationer.
Vijay Shankar Balakrishnans ph.d.-projekt omhandler, hvordan AMP’en Novicidin, afledt af fåre-defensiner, vekselvirker med cellemembraner. Disse vekselvirkninger er undersøgt med forskellige biofysiske metoder med brug af kunstige membransystemer (liposomer). Liposomer består af fedtmolekyler, de såkaldte fosfolipider, og de fysiske teknikker er blevet brugt for at forstå den fysisk-kemiske basis for disse vekselvirkninger. Forskellige spektroskopiske og kalorimetriske metoder blev brugt til at undersøge, hvordan lipiderne ændrer peptidets struktur og vice versa. Det viser sig, at disse vekselvirkninger er yderst følsomme overfor fosfolipidernes sammensætning; ændringer i lipidernes kemiske sammensætning og elektrostatiske ladning påvirker grundlæggende, hvordan Novicidin kan binde til membranen.
Ph.d.-studiet er gennemført ved Interdisciplinært Nanoscience Center (iNANO), Faculty of Science and Technology, Aarhus Universitet.
Tid: Mandag den 19. november 2012 kl. 12.30
Sted: 1593-012, Auditoriet, iNANO-huset, Gustav Wieds Vej 14, Aarhus Universitet
Afhandlingens titel: Novicidin interactions with phospholipid membranes: A dossier
Kontaktinfo: Vijay Shankar Balakrishnan, e-mail: vijay@inano.dk
Bedømmelsesudvalg:
Lektor Chad Leidy, Department of Physics, Universidad de los Andes, Bogota, Colombia
Seniorforsker Thomas L. Andresen, DTU Nanotech, Danmarks Tekniske Universitet
Professor Troels Skrydstrup (formand), iNANO og Institut for Kemi, Aarhus Universitet
Hovedvejleder:
Professor Daniel Otzen, iNANO og Institut for Molekylærbiologi og Genetik, Aarhus Universitet
Sprog: Ph.d.-afhandlingen forsvares på engelsk.
Forsvaret er offentligt.
Afhandlingen ligger til gennemsyn hos Graduate School of Science and Technology/GSST, Ny Munkegade 120, bygning 1521, lokale 112, 8000 Aarhus C.