Gernot Wolf: Pattedyrs cellulære forsvarsmekanismer til genkendelse og kontrol af virus-parasitter, der nedarves som en del af genomet

Retrovira er i stand til stabilt at integrere deres genom i DNA'et i inficerede celler. Hvis retroviral integration sker i kimbaneceller, kan retrovira blive en del af værtens genom, og nedarves fra generation til generation som en genomisk parasit. Disse endogene retrovira (ERV) udgør en stor del af mammale genomer og kan forårsage alvorlige forstyrrelser af genomiske og cellulære funktioner i deres værter. Nylige undersøgelser peger på, at i det mindste nogle af de flere hundrede mammale KRAB zinkfinger-proteiner (KRAB-ZFP'er), en stor familie af DNA-bindende transskriptionsfaktorer, har udviklet sig til at genkende og begrænse ERV på en specifikt målrettet måde.
Under sine studier har Gernot Wolf undersøgt evolutionære og mekanistiske aspekter af epigenetisk ERV-kontrol i forskellige pattedyrearter. Undersøgelserne omfattede helgenomanalyser af transskriptionsfaktor-binding ved anvendelse af ny sekventeringsteknologi og frembringelsen af en knock-out musemodel, der muliggør undersøgelse af funktionen af en ERV-målrettet KRAB-ZFP in vivo.
De nye forskningsresultater bidrager til forståelsen af, hvordan ERV bliver genkendt og kontrolleret af værtsrestriktionsfaktorer, og beskriver en ny mekanisme, som hvorved ERV kan ændre udtryksprofilen af værtsgener.

Ph.d.-studiet er gennemført ved Institut for Molekylærbiologi og Genetik, Aarhus Universitet

Tid: Torsdag den 7 marts 2013 kl. 14.00
Sted: Auditorium G2 (1532-122), Institut for Matematik, Aarhus University
Afhandlingens titel: Target-specific epigenetic silencing of endogenous retroviruses in mammals
Kontaktinfo: Gernot Wolf, e-mail: gwolf@mb.au.dk, tel.: +45 60415807
Bedømmelsesudvalg:
Professor Anders H. Lund, Biotech Research and Innovation Centre (BRIC), Københavns Universitet
Professor Christine Leib-Mösch, Helmholtz Zentrum München, Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt, Germany
Lektor Bjarne Juul Bonven (formand), MBG, Aarhus Universitet
Hovedvejleder:
Professor Finn Skou Pedersen, MBG, Aarhus Universitet
Medvejleder:
Professor Anders Lade Nielsen, Institut for Biomedicin, Aarhus Universitet
Sprog: Ph.d.-afhandlingen forsvares på engelsk.

Forsvaret er offentligt.
Afhandlingen ligger til gennemsyn hos Graduate School of Science and Technology/GSST, Ny Munkegade 120, bygning 1521, lokale 112, 8000 Aarhus C.