Mette Dalgaard Ebbesen Jepsen: Måling af afstande i syntetiske biologiske strukturer med nanometer præcision

Ud af menneskers arvemasse (DNA) er det muligt at folde syntetiske strukturer som potentielt kan benyttes til forskellige praktiske formål, for eksempel i forbindelse med medicinsk behandling. Dette gøres ved hjælp af en teknik kaldet "DNA origami", som benytter specielle egenskaber i DNA'et til at folde strukturen efter samme principper, som benyttes, når man for eksempel laver en lotusblomst ved at folde almindeligt papir, bortset fra at der i DNA'ets natur opereres med meget små størrelser. I løbet af ph.d.-studiet har Mette Dalgaard Ebbesen Jepsen undersøgt flere forskellige strukturer dannet ud fra dette princip, blandt andet en boks lavet af DNA, som på kontrolleret vis kan åbnes og lukkes.

For at analysere strukturelle ændringer i disse DNA strukturer har Mette Dalgaard Ebbesen Jepsen brugt en metode, hvor lys bliver anvendt til at måle meget små afstande, nemlig mellem 2 og 10 nm. 10 nm svarer til 0,00001 mm, og til sammenligning er et punktum i denne tekst ca. 0,5 mm, altså 50.000 gange større. Metoden blev for eksempel benyttet til at måle afstanden mellem låget og selve boksen. Ved at undersøge denne afstand har vi vist, at boksen kun åbnes i nærheden af bestemte biomolekyler. Disse biomolekyler er for eksempel til stede på overfladen af syge celler, og på den måde kan kassen bruges til at transportere medicin hen i nærheden af de syge celler.

Ph.d.-studiet er gennemført ved Interdisciplinært Nanoscience Center (iNANO), Science and Technology, Aarhus Universitet.

Tid: Onsdag den 27. august 2014 kl. 13.15
Sted: 1110-223, Auditoriet, C. F. Møllers Allé 8, Aarhus Universitet
Afhandlingens titel: Nucleic Acid Nanostructures Studied by FRET
Kontaktinfo: Mette Dalgaard Ebbesen Jepsen, e-mail: mettebj@inano.au.dk
Bedømmelsesudvalg:
Professor Tim Liedl, Faculty of Physics, Ludwig-Maximillians Universität München, Tyskland
Professor, Head of the Lundbeck Foundation Center for Biomembranes in Nanomedicine Dimitrios Stamou, Nano-Science Center and institute of Chemistry, Københavns Universitet
Professor Daniel Otzen (formand), iNANO og Institut for Molekylærbiologi og Genetik, Aarhus Universitet
Hovedvejleder:
Professor Jørgen Kjems, iNANO og Institut for Molekylærbiologi og Genetik, Aarhus Universitet
Medvejleder:
Lektor Victoria Birkedal, iNANO, Aarhus Universitet
Sprog: Ph.d.-afhandlingen forsvares på engelsk.

Forsvaret er offentligt.
Afhandlingen ligger til gennemsyn hos Graduate School of Science and Technology/GSST, Ny Munkegade 120, bygning 1521, lokale 112, 8000 Aarhus C.