Aarhus Universitets segl

Zsuzsanna Sükösd: Viral RNA strukturforudsigelse: Afkodning af evolutionens sprog

Ph.d.-forsvar, fredag den 22. november 2013. Cand. scient. Zsuzsanna Sukösd

Zsuzsanna Sükösd
Forudsigelsen af HIV-1 genomets sekundære struktur er blevet lavet ved hjælp af PPfold. Forudsigelsen bruger både evolutionær information og SHAPE-data.

Nogle virus, såsom HIV, opbevarer deres genetiske information i form af RNA. Zsuzsanna Sükösds afhandling handler om modeller, der beskriver RNA-struktur ved at integrere teoretisk og eksperimentel information. Det kræver en interdisciplinær tilgang, hvor biologi, matematik og datalogi mødes. En af de centrale metoder, hun har arbejdet med, er endda udviklet for at modellere sprog i teoretisk lingvistik; den anvendes her til at beskrive evolutionens sprog. Zsuzsanna Sükösd har også anvendt sine teoretiske forskningsresultater til at fremstille en ny sekundær strukturmodel for HIV-1 genomet.

Ph.d.-studiet er gennemført ved Interdisciplinært Nanoscience Center og Bioinformatics Research Centre ved Faculty of Science and Technology, Aarhus Universitet.

Tid: Fredag den 22. november, 2013, kl. 13.15
Sted: 1110-223, Auditoriet, Bioinformatics Research Centre (BIRC), Aarhus Universitet
Titel på afhandlingen: Viral RNA secondary structure prediction
Kontaktinfo: Zsuzsanna Sükösd, email: zs@birc.au.dk
Bedømmelsesudvalg:
Professor Stuart F.J. Le Grice, RT Biochemistry Section, HIV Drug Resistance Program, National Cancer Institute – Frederick, USA
Professor Rolf Backofen, Lehrstuhl für Bioinformatik, Institut für Informatik, Albert-Ludwigs-Universität Freiburg, Tyskland
Lektor Rikke Louise Meyer (formand), iNANO og Institut for Bioscience, Aarhus Universitet
Hovedvejleder:
Professor Jørgen Kjems, iNANO og Institut for Molekylærbiologi og Genetik, Aarhus Universitet
Medvejleder:
Lektor Christian Nørgaard Storm Pedersen, Bioinformatics Research Centre (BiRC), Aarhus Universitet
Sprog: Ph.d.-afhandlingen forsvares på engelsk.

Forsvaret er offentligt.
Afhandlingen ligger til gennemsyn hos Graduate School of Science and Technology/GSST, Ny Munkegade 120, building 1521, room 112, 8000 Aarhus C.