Anna Ma?olepszy: LORE1 insertionsmutagenese i Lotus japonicus er et effektivt værktøj i identifikationen af mulige gener involveret i etableringen af bælgplanter-rhizobia symbiose

Under sine studier etablerede Anna Ma?olepszy en high-throughput forsøgsopstilling for LORE1 insertionsmutagenese i model-bælgplanten Lotus japonicus. LORE1 er et endogent retrotransposon, som kan undertrykkes epigenetisk i vævskultur af Lotus. Takket være det todimensionelle (2D) planteeksperiment, pooling-strategi og illumina-sekventering kan alle insertioner let identificeres på hver linje.

Efterfølgende igangsatte Anna Ma?olepszy en fremadrettet screening-undersøgelse af LORE1-populationen og påviste, at den med succes kan bruges til at identificere de nye gener, der er involveret i etableringen af symbiosen mellem bælgplanter og Rhizobium-bakterier. De nye alleler af velkendte rodknolds-mutanter blev bekræftet, og den nye symbiotiske mutant blev identificeret og yderligere undersøgt. Studierne viste en vellykket etablering af et effektivt værktøj til mutagenese, som letter processen med at identificere genfunktioner i Lotus.

Ph.d.-studiet er gennemført ved Institut for Molekylærbiologi og Genetik ( Center for Kulhydratgenkendelse og -Signalering / CARB), Science and Technology, Aarhus Universitet.

Tid: Mandag den 17. februar 2014, kl. 13.00
Sted: Meeting Room 2, AU conference centre, Fredrik Nielsens Vej 2-4
Afhandlingens titel: : Establishing and screening of a Lotus japonicus LORE1 mutagenized population
Kontaktinfo: Anna Ma?olepszy, e-mail: ann@mb.au.dk
Bedømmelsesudvalg:
Lektor Fred Rook, Institut for Plante- og Miljøvidenskab, Københavns Universitet, Danmark
Dr. Pascal Ratet, Institut des Sciences du Végétal, CNRS, Gif sur Yvette Cedex, Frankrig
Professor Claus Oxvig (formand), ), Institut for Molekylær Biologi og Genetik, Aarhus Universitet
Hovedvejleder: Professor Jens Stougaard, CARB, Aarhus Universitet, Danmark
Medvejleder: Dr. Stig U. Andersen
Sprog: Ph.d.-afhandlingen forsvares på engelsk