Aarhus Universitets segl

Ditlev E. Brodersen

Bakterielle overlevelses- og resistensmekanismer

Bakterier lever i konstant kamp for overlevelse og tilpasser sig hele tiden deres omgivelser. Denne tilpasningsevne ligger bag alvorlige globale problemer som udviklingen af antibiotikaresistens, der forventes at koste op mod 10 millioner menneskeliv årligt inden for de næste 25 år. Samtidig må bakterier beskytte sig mod deres naturlige fjender såsom virus (bakteriofager) og udvinde næringsstoffer fra ofte meget næringsfattige miljøer.

I vores forskningsgruppe undersøger vi de molekylære mekanismer, der gør bakterier i stand til at overleve under sådanne ekstreme betingelser. Vi kombinerer metoder fra mikrobiologi, biokemi, biofysik, bioinformatik og strukturbiologi for at opnå en detaljeret forståelse af centrale biologiske processer, herunder:

  • Antibiotikatolerans, herunder hvordan mutationer gradvist kan føre til resistens.

  • Forsvar mod bakteriofager, med særligt fokus på toksin–antitoksin-systemer og kinaser.

  • Bakteriel sultrespons, især enzymkomplekser som C–P lyase, der kan frigive fosfor fra organiske fosfonater.

Vores mål er at afdække de strukturelle og funktionelle principper, der ligger bag bakteriers tilpasning og selvforsvar – og derved skabe ny viden, der kan bidrage til forståelsen af infektionssygdomme og udviklingen af fremtidige behandlingsstrategier.

Studenterprojekter

BSc- og MSc-studerende samt kommende ph.d.-studerende og postdocs er velkomne til at kontakte Ditlev Brodersen (se kontaktoplysninger ovenfor) for yderligere information og for at arrangere et uformelt besøg i laboratoriet.

Som studerende i gruppen vil du få mulighed for at arbejde med:

  • Bioinformatik: Mikrobiel genomanalyse og fylogeni.
  • Design af DNA-konstrukter: In silico og i laboratoriet med PCR, plasmidkloning og mutagenese.
  • Mikrobiologi: Vækstforsøg, spot assays, in vivo komplementering, isolering af bakteriofager og plaque assays.
  • Proteinoprensning: Søjlekromatografi, enzymologi og funktionelle analyser.
  • Biofysik: DNA- og RNA-binding, massedetermination, MST, proteinstabilitet og Isothermal Titration Calorimetry (ITC).
  • Strukturel analyse: Røntgenkrystallografi eller cryo-EM.